Green Cargo ägs till 100 procent av Svenska staten, förvaltas av Näringsdepartementet och ingår i gruppen "Företag med marknadsmässiga krav". Det övergripande målet för dessa företag är marknadsmässig avkastning. Dessutom har regeringen identifierat policyfrågor där statligt ägda företag ska agera föredömligt. Det gäller bland annat jämställdhetsfrågor, miljö, mångfald, en frisk arbetsplats och företagets roll i samhället.
Näringsdepartemetet arbetar framförallt med tre verktyg för att styra statliga bolag: styrelsesammansättning, revisorer och genomlysning.
Green Cargos styrelse är utsedd av Näringsdepartementet. Kraven på Green Cargos rapportering är i linje med dem som ställs på börsnoterade företag.
